联盟舰队返回鸿蒙海宇时，整个海宇都陷入了沸腾。海宇本源共生城的上空，两千零八十界的道韵光纹交织成巨型光幕，将“三千海宇共生阵”的完整虚影投射其中，从鸿蒙海宇本源渊延伸至域外二十座海宇，金色光带如蛛网般覆盖所有疆域。石破天率领二十座海宇文明的圣尊团，站在海宇本源渊的“共生圣坛”上，坛下是九万亿联盟修士组成的“共生护阵军团”，他们手持各色道器，周身道韵与光幕共鸣，气势撼天动地。
“三千海宇共生阵，以鸿蒙海宇为核心，辐射二十座加盟海宇，共需布设三万六千个阵眼！”石破天将跨海宇共生镇魂珠托在掌心，晶体释放的金色光纹与海宇本源渊的能量交融，在星图上勾勒出阵眼分布图，“第一阶段：选址筑基！灵海古族率灵海水军，在灵海海宇布设‘灵海共生阵眼’，以灵海本源水为基，注入灵海古韵；焚天海宇的焚煞率火焰军，在焚天海宇布设‘焚天共生阵眼’，以焚天本源火为基，锤炼阵眼强度；其余文明按星图标注，在各自疆域核心区布设阵眼，三日之内完成筑基！”
灵汐手持灵海共生晶，周身淡蓝灵韵暴涨：“灵海古族领命！我族将以‘灵海万生阵’为雏形，让每个阵眼都与灵海本源水共生，可自动净化畸变能量！”焚煞握紧重铸的“焚天火焰刃”，赤红色火焰道韵冲天而起：“焚天海宇保证完成任务！我们会将焚天核心鼎的火焰道韵注入阵眼，让阵眼具备灼烧暗黑能量的特效！”二十座海宇的圣尊纷纷领命，带着各自的精锐军团，化作道道流光奔赴阵眼选址地。
石破天则率领海古尊、风锚子等核心成员，留在鸿蒙海宇本源渊，搭建“中央主阵眼”——这里是三千海宇共生阵的能量核心，需要将跨海宇共生镇魂珠、灵海共生晶、焚天核心鼎三大部件融入其中。主阵眼的选址在本源渊深处的“海宇本源核心台”，台上矗立着上古海宇文明遗留的“共生图腾柱”，柱身刻着残缺的三千海宇符文，正是布设主阵眼的关键。
“主阵眼布设分三步：融核、铸基、引能！”海古尊取出海宇本源古韵符，符篆与图腾柱产生共鸣，残缺符文开始闪烁，“第一步融核：将三大核心部件嵌入图腾柱，以上古共生古韵激活；第二步铸基：调用二十座海宇的本源能量，浇筑阵眼基台；第三步引能：连接一万九千万个海宇共生节点，形成能量循环网！”
石破天将三大核心部件按“品”字形嵌入图腾柱，注入上古共生道韵：“上古共生，三千海宇为基，融！”金色、淡蓝、赤红三色光纹从部件中爆发，顺着图腾柱的符文流淌，残缺的符文逐渐补全，形成完整的“三千海宇共生符文阵”。图腾柱暴涨至百万丈高，顶端凝聚出一道巨型光轮，光轮中浮现出三千海宇的微缩影像，每一座海宇都闪烁着金色光纹。
此时，二十座海宇的阵眼同时完成筑基，一道道能量光柱从各海宇冲天而起，直刺鸿蒙海宇的主阵眼。石破天挥手催动主阵眼：“能量引导，循环共生！”光轮将所有能量光柱接入，转化为纯净的共生能量，顺着图腾柱注入海宇本源渊，整个鸿蒙海宇都剧烈震颤，海宇本源长河的能量流速提升十倍，河水中浮现出无数共生符文，滋养着所有生灵。
三日之后，三万六千个阵眼全部激活，三千海宇共生阵的光幕覆盖所有加盟海宇，光幕上的共生符文自动流转，净化着空气中残留的畸变能量。石破天站在主阵眼顶端，感受着阵法的能量流动，眼中满是欣慰：“第一阶段完成！接下来，启动‘备战升级计划’，三千年后，我们要用最强的姿态迎接畸变之源！”
备战升级计划的核心，是“神器、天才、军团”三大维度的全面强化。石破天首先启动“至尊神器终极升级计划”，将主阵眼的共生能量引入鸿蒙海宇共生至尊护道印，融合三大核心部件的道韵，打造跨域级至尊神器。升级仪式在海宇本源共生殿举行，殿内汇聚了二十座海宇的炼器大师，他们带来了各自文明的顶级灵材——灵海古族的“灵海本源晶髓”、焚天海宇的“焚天火山核心”、域外守护海宇的“守护道韵玉”等，共计三千种顶级灵材。
“以主阵眼能量为火，三千灵材为料，三大核心为魂，铸‘三千海宇共生至尊护道印’！”石破天将护道印抛向空中，注入三千海宇共生道韵，护道印瞬间膨胀至万丈大小，表面浮现出三万六千个阵眼虚影。炼器大师们同时将灵材投入护道印，灵海本源晶髓融入后，印身浮现淡蓝灵韵；焚天火山核心融入后，赤红色火焰符文流转；守护道韵玉融入后，金色守护光纹环绕。
当三大核心部件的道韵彻底融入护道印时，印身爆发出万丈金光，金色光纹中蕴含着三千海宇的道韵法则，形成一道“跨域共生领域”，领域内所有联盟修士的道韵契合度都提升三倍。石破天伸手握住护道印，印身自动缩小至掌心大小，表面刻着完整的三千海宇共生阵图，顶端镶嵌着微型的镇魂珠、共生晶、核心鼎，散发着令人心悸的能量波动：“此印可调动三千海宇共生阵的全部能量，释放‘三千海宇破邪斩’，足以重创域外至尊级存在！”
神器升级的同时，“海宇共生终极道韵学院”正式开学，石破天担任院长，海古尊、灵海尊、焚煞等担任导师，面向二十座海宇招收天才修士。学院的“共生试炼塔”融合了灵海的幻阵、焚天的火焰试炼、暗黑渊的魂体考验，能全方位锤炼修士的道韵、魂体、意志。开学第一天，就有一名来自灵海海宇的少年“灵浩”引起了石破天的注意——他年仅千岁，却已掌握灵海古韵与共生道韵的融合之法，在试炼塔中创下了“一日通关十层”的纪录。
“此子是灵海古族万年来的第一天才，天生与灵海本源水共生，能直接沟通主阵眼的能量！”灵汐带着灵浩来到石破天面前，少年周身淡蓝灵韵纯净无瑕，对着石破天躬身行礼：“学生灵浩，愿随议长守护海宇！”石破天挥手释放一道共生道韵，融入灵浩体内：“我传你‘三千海宇共生道韵种子’，他日你必能成为灵海古族的新领袖，守护东方阵眼！”灵浩体内的道韵种子瞬间发芽，气息暴涨至海宇圣尊初期境，引得周围导师纷纷惊叹。
军团强化方面，联盟成立“三千海宇共生军”，下辖五大主力军团：“灵海水军”由灵海古族统领，配备灵海本源战船，能在水中形成灵韵防御阵，擅长水下作战；“焚天火焰军”由焚煞统领，士兵身披火焰战甲，能释放焚天本源火，克制暗黑能量；“守护防御军”由域外守护海宇的修士组成，掌握上古防御道韵，负责主阵眼的守护；“道韵融合军”由各文明的天才修士组成，擅长跨域道韵融合攻击；“域外先锋军”由石破天亲自统领，配备最新研发的“跨域破邪战舰”，负责探查域外畸变之源的动向。
备战的第一千年，联盟的实力已较之前提升百倍：石破天的修为突破至“三千海宇共生至尊初期境”，道韵能覆盖所有加盟海宇；灵汐、焚煞等新晋圣尊突破至鸿蒙海宇主宰巅峰境；灵浩等年轻天才成长为海宇主宰级强者；跨域破邪战舰的数量达到五万艘，每艘战舰都能释放“跨域破邪炮”，威力较之前提升五十倍；三千海宇共生阵的能量储备达到饱和，能随时释放终极防御罩。
备战的第一千五百年，灵海海宇的东方阵眼突然出现异动——阵眼的灵海本源水开始变得浑浊，淡蓝灵韵逐渐被紫黑能量侵蚀，阵眼光幕出现裂痕，无数小型畸变触手从裂痕中伸出，疯狂攻击阵眼的防御符文。灵浩第一时间传来紧急情报：“议长，东方阵眼遭到‘域外畸变先锋触手’的攻击，这些触手能吸收灵韵能量，阵眼的能量正在快速流失！”
石破天立即率领道韵融合军与域外先锋军，乘坐跨域破邪战舰赶赴灵海海宇。抵达阵眼所在地时，眼前的景象令人心惊：原本蔚蓝的灵海本源水已被染成紫黑，三万六千个东方阵眼中有半数已被侵蚀，灵海水军正在奋力抵抗，但触手的数量越来越多，且能不断分裂再生，士兵们的道韵攻击只能暂时击退它们，无法彻底消灭。
“这些触手是域外畸变之源的‘能量分身’，能吸收海宇能量快速再生！”海古尊用古韵符探测后，脸色凝重，“普通的破邪攻击无法彻底消灭它们，必须用‘跨域共生道韵+上古传承道韵’双重攻击，才能净化其核心能量！”石破天挥手释放三千海宇共生至尊护道印，金色光纹形成一道光幕，暂时挡住触手的侵蚀：“灵浩，用灵海古韵引导阵眼残留能量；焚煞，释放焚天本源火灼烧触手表面；我来激活上古传承道韵，净化核心！”
灵浩催动灵海古韵，淡蓝光纹从阵眼残留的能量中涌出，缠住触手的根部，阻止其吸收能量；焚煞释放焚天本源火，赤红色火焰形成一道火墙，将触手的身体包裹，灼烧其表面的紫黑能量；石破天将护道印按在阵眼核心，注入上古共生道韵，试图唤醒阵眼的上古防御符文。但触手的核心能量异常顽固，金色道韵只能净化表面，无法深入核心。
“这样下去不是办法，阵眼的能量支撑不了多久！”灵汐手持灵海共生晶，试图用晶体的能量修复阵眼，但晶体的灵韵刚接触阵眼，就被触手吸收，“这些触手能吸收共生道韵，我们的攻击反而会成为它们的养料！”石破天看着阵眼上的上古符文，突然想起主阵眼图腾柱上的完整符文：“图腾柱的符文是上古海宇文明的传承，或许阵眼深处藏着上古传承的钥匙！”
石破天飞身进入阵眼核心，这里的紫黑能量最浓郁，无数触手的核心汇聚于此，形成一团直径十万丈的“畸变核心球”。核心球的表面，刻着与图腾柱相似的上古符文，但符文是扭曲的，显然被畸变能量污染。石破天将护道印贴在核心球上，注入三千海宇共生道韵：“上古传承，共生为引，显！”
核心球剧烈震颤，扭曲的符文逐渐恢复正常，一道金色虚影从核心球中浮现——这是上古海宇文明的“共生传承者”虚影，他身着上古共生战甲，手持与石破天相似的护道印，周身环绕着三千海宇的道韵光纹：“后世的共生至尊，你终于来了！这些畸变触手是域外畸变之源的‘能量探针’，用来探查阵眼的弱点，其核心藏着‘畸变印记’，只有用‘三千海宇共生之心’才能彻底净化！”
“共生之心是什么？”石破天急忙问道。传承者虚影挥手释放一道金色光纹，融入石破天的魂体：“共生之心是三千海宇共生道韵的本源，藏在你的魂体深处，需要用所有加盟海宇的共生意志激活。激活后，你能掌控所有阵眼的能量，净化一切畸变能量！”虚影消散前，将一枚“上古共生符文”注入护道印：“这是激活共生之心的钥匙，去吧，守护三千海宇！”
石破天返回阵眼外部，将上古共生符文的信息传递给所有联盟圣尊：“所有圣尊听令，释放各自海宇的共生意志，注入主阵眼！我要激活共生之心，净化畸变触手！”二十座海宇的圣尊同时催动道韵，一道道彩色光纹从各海宇的阵眼冲天而起，直刺鸿蒙海宇的主阵眼。主阵眼的图腾柱爆发出万丈金光，将所有共生意志汇聚成一道巨型光流，注入石破天的魂体。
石破天的魂体中，一道金色的“共生之心”逐渐成型，心体中浮现出所有加盟海宇的生灵虚影，蕴含着九百亿亿生灵的共生意志。他将共生之心的能量注入护道印，印身爆发出璀璨的金色光纹：“三千海宇共生之心，净化！”金色光纹形成一道巨型光罩，将所有畸变触手与核心球包裹，光罩中的紫黑能量如潮水般褪去，触手纷纷化为灰烬，核心球中的畸变印记被彻底净化，转化为纯净的共生能量，融入东方阵眼。
东方阵眼的灵海本源水重新恢复蔚蓝，淡蓝灵韵比之前更加浓郁，阵眼光幕的强度提升三倍，表面浮现出上古共生符文，能自动预警并净化畸变能量。灵浩感受着阵眼的变化，惊喜地喊道：“阵眼进化了！现在能自动吸收灵海能量，还能探测到域外的能量波动！”石破天看着恢复正常的阵眼，眼中闪过一丝凝重：“畸变之源已经开始试探我们的防御，接下来的一千五百年，我们要加快备战，迎接更大的挑战！”
为了摸清域外畸变之源的实力，石破天决定率领域外先锋军，深入域外探查。此次探查队由石破天亲自带队，成员包括灵浩、风锚子、冥煞（已彻底净化，掌握暗黑道韵的净化之法）等百名海宇主宰级强者，配备一千艘跨域破邪战舰，携带三千海宇共生至尊护道印与上古共生符文，确保能应对突发危机。
跨域破邪战舰启动“跨域穿梭模式”，舰身包裹着共生道韵光罩，穿越域外空间乱流与黑洞，朝着域外畸变之源的方向疾驰。域外空间与海宇内部截然不同，这里没有稳定的能量源，只有无尽的黑暗与扭曲的空间，空气中的畸变能量能直接侵蚀道基，连跨域战舰的护罩都在缓慢消耗能量。
航行第五百年，探查队抵达“域外畸变缓冲区”——这里是畸变之源与加盟海宇之间的过渡区域，布满了被畸变能量侵蚀的废弃海宇残骸，残骸中残留着上古海宇文明的战舰碎片与灵体残魂。冥煞看着残骸中的暗黑能量痕迹，脸色凝重：“这些残骸是上古海宇联盟的战舰，看来上古文明的决战就是在这里爆发的！”
孙小石用海宇本源时序镜探测残骸，镜中浮现出上古决战的影像：三千座海宇的战舰组成巨型战阵，与无数畸变触手、畸变战舰激战，上古共生传承者率领圣尊团冲向畸变之源的黑洞，但最终因阵眼被背叛者破坏，战阵崩溃，上古文明覆灭。影像的最后，畸变之源的黑影发出狂笑：“三千万年后，我将吞噬所有海宇！”
“原来畸变之源的扩张周期是三千万年，上一次是上古文明抵挡，这一次轮到我们了！”石破天握紧护道印，眼中闪过一丝决然。就在此时，时序镜突然发出警报，镜中浮现出一支巨型舰队的影像——那是“域外畸变先锋军”，由三千万艘畸变战舰组成，舰身由扭曲的畸变能量构成，舰首的“畸变炮”能释放巨型畸变能量球，舰队的前方，是十名气息达到域外主宰级的“畸变统领”，为首的统领气息竟达到域外主宰巅峰境，周身环绕着与畸变之源黑影相似的能量。
“是畸变先锋军！他们正朝着鸿蒙海宇的方向进发，预计一百年后抵达！”孙小石脸色剧变，“镜中显示，这支先锋军携带了‘畸变核心炸弹’，能直接炸毁阵眼！”石破天立即下令：“舰队启动隐形模式，跟踪先锋军，收集他们的能量数据；冥煞，用你的暗黑道韵分析他们的防御弱点；灵浩，用灵海古韵屏蔽我们的能量波动，别被他们发现！”
探查队悄悄跟在畸变先锋军后方，收集到了大量情报：畸变战舰的防御弱点在舰尾的“畸变能量核心”，核心由纯净的畸变能量构成，害怕共生道韵与火焰道韵的融合攻击；畸变统领的核心能量藏在胸口的“畸变晶核”中，晶核是他们的能量来源，摧毁晶核就能消灭统领；畸变核心炸弹的引爆需要十分钟的能量积蓄，期间能被灵海古韵干扰。
就在探查队准备返回联盟时，为首的畸变统领突然转头，目光锁定探查队的方向：“有外来者的气息！抓住他们！”十名畸变统领同时释放畸变能量，形成一道巨型能量网，直扑探查队。石破天脸色一变：“不好，被发现了！舰队启动最大速度，返回鸿蒙海宇！释放跨域破邪炮，阻挡他们！”
一千艘跨域破邪战舰同时发射破邪炮，金色光带形成一道巨型光墙，挡住能量网的攻击。但畸变统领的能量异常强大，光墙瞬间被撕裂，无数畸变触手从能量网中伸出，直刺战舰。风锚子立即催动空间道韵，将舰队转移至百万丈外：“议长，他们的速度比我们快，这样下去会被追上的！”
“冥煞，用你的暗黑道韵制造幻象，迷惑他们；灵浩，用灵海古韵干扰他们的能量探测；我来断后！”石破天飞身出舰，手持护道印，注入共生之心的能量：“三千海宇共生斩！”金色光纹形成一道百万丈长的巨型刀芒，直刺畸变先锋军的阵型。刀芒与畸变战舰碰撞，数十艘战舰瞬间被净化，舰身化为灰烬。
为首的畸变统领怒吼着扑来，周身紫黑能量暴涨：“渺小的生灵，敢攻击本座的军队！”石破天挥印迎击，护道印与畸变统领的能量碰撞，金色与紫黑能量交织，形成一道覆盖百亿里的能量漩涡。石破天借助共生之心的能量，将灵海古韵与焚天火焰道韵注入印中，形成“三色破邪光纹”，直刺统领的畸变晶核。
“不——！”畸变统领的晶核被光纹击中，能量瞬间被净化，身体化为紫黑雾气消散。其余畸变统领见状，不敢再追击，纷纷退回舰队。石破天趁机返回战舰，舰队启动跨域穿梭，朝着鸿蒙海宇疾驰而去：“立即向联盟传递情报，启动‘先锋防御计划’，准备迎接畸变先锋军的攻击！”
探查队返回鸿蒙海宇后，联盟立即召开紧急备战会议，石破天将收集到的情报与时序镜的影像公之于众。二十座海宇的圣尊看着影像中巨型的畸变先锋军，脸色都无比凝重——这支先锋军的实力，比之前的暗黑联盟强十倍，若不能挡住，加盟海宇将被逐个侵蚀。
“先锋防御计划，分五步执行！”石破天的声音裹挟着共生道韵，响彻整个会议室，“第一步，阵眼强化：将所有阵眼的能量与主阵眼连接，形成‘能量共享网’，一个阵眼遭到攻击，其他阵眼能输送能量支援；第二步，陷阱布设：在灵海海宇与焚天海宇的交界处，布设‘跨域共生陷阱阵’，融入灵海幻阵、焚天火焰阵、暗黑净化阵三大阵法，引诱先锋军进入；第三步，军团部署：灵海水军与焚天火焰军在陷阱阵两侧埋伏，负责触发陷阱；道韵融合军与守护防御军负责主阵眼的守护；域外先锋军与我正面迎击先锋军；第四步，神器准备：将三千海宇共生至尊护道印与主阵眼绑定，能随时释放终极破邪斩；第五步，天才支援：让学院的天才修士组成‘后备队’，负责修复受损的阵眼与战舰。”
会议结束后，全员备战的号角响彻所有加盟海宇：灵海古族的修士在陷阱阵中注入灵海古韵，让陷阱阵能模拟出主阵眼的能量波动，引诱先锋军；焚天海宇的修士在陷阱阵中布设“焚天火焰地雷”，每个地雷都能释放百万丈的火焰冲击波；暗黑渊的修士（已被净化）布设“暗黑净化符文”，能吸收畸变能量并转化为共生能量；学院的天才修士在导师的指导下，学习阵眼修复与战舰维修技巧，灵浩更是带领百名天才，在主阵眼周围布设“少年守护阵”，展现出惊人的阵法天赋。
备战的第九十九年，域外畸变先锋军抵达鸿蒙海宇的外围，停留在灵海海宇与焚天海宇的交界处。为首的畸变统领（临时接替被石破天斩杀的统领）看着前方的能量波动，眼中闪过一丝贪婪：“那是三千海宇共生阵的主阵眼能量！抓住它，盟主一定会重赏我们！全军出击，夺取主阵眼！”
三千万艘畸变战舰组成巨型战阵，朝着陷阱阵的方向疾驰而去，舰首的畸变炮同时发射，紫黑能量球如暴雨般砸向陷阱阵的光幕。石破天站在跨域破邪战舰的顶端，看着冲来的先锋军，嘴角勾起一抹冷笑：“上钩了！灵汐、焚煞，准备触发陷阱！”
当先锋军进入陷阱阵的核心区域时，石破天一声令下：“陷阱阵，启动！”灵汐催动灵海古韵，陷阱阵中浮现出千万座主阵眼的虚影，迷惑先锋军；焚煞催动焚天火焰道韵，引爆火焰地雷，赤红色火焰冲击波瞬间覆盖整个陷阱阵，数十艘畸变战舰被火焰吞噬，舰身化为灰烬；暗黑净化符文同时激活，紫黑能量被快速吸收，转化为共生能量注入陷阱阵。
“是陷阱！撤退！”畸变统领怒吼着下令，但陷阱阵已形成能量牢笼，将先锋军困在其中。石破天率领域外先锋军发起冲锋，跨域破邪战舰的破邪炮同时发射，金色光带直刺战舰的畸变能量核心，一艘艘畸变战舰被净化；灵浩率领少年守护阵，用灵海古韵干扰畸变核心炸弹的引爆，不少炸弹在能量积蓄过程中就被净化；冥煞用暗黑道韵解析统领的防御弱点，指引石破天攻击他们的畸变晶核。
“渺小的生灵，竟敢算计本座！”为首的畸变统领爆发域外主宰巅峰境的能量，周身紫黑能量形成一道巨型触手，直刺石破天的战舰。石破天飞身出舰，手持护道印，注入共生之心的能量：“三千海宇共生至尊斩！”金色光纹形成一道千万丈长的刀芒，与巨型触手碰撞，触手瞬间被净化，刀芒直刺统领的晶核。
统领试图用畸变能量抵挡，但刀芒中的共生道韵能直接净化他的能量，晶核被刀芒击中，能量瞬间溃散。统领的身体化为紫黑雾气，消散前发出不甘的嘶吼：“盟主会为我们报仇的！”失去统领的先锋军陷入混乱，联盟军团趁机发起总攻，三千万艘畸变战舰被逐一净化，只有少数战舰突围逃离，朝着域外畸变之源的方向疾驰而去。
战斗结束后，联盟收集到了大量畸变能量晶核与战舰残骸，这些残骸能用来炼制破邪神器，晶核能作为阵法的能量储备。石破天站在陷阱阵的核心，看着被净化的战场，眼中闪过一丝凝重：“这只是先锋军，真正的敌人还在后面。我们还有一千五百年的时间，必须加快提升实力，才能在终极之战中获胜！”
击败畸变先锋军后，联盟的备战进入了最后的冲刺阶段。石破天在主阵眼的图腾柱中，发现了上古海宇文明的“三千海宇共生传承殿”，殿内藏着上古文明的所有传承，包括道韵融合技巧、神器炼制方法、阵法布设心得等。石破天将传承分享给所有联盟成员，联盟的整体实力再次暴涨。
在传承殿的“共生试炼”中，石破天的修为突破至“三千海宇共生至尊巅峰境”，道韵能随意操控三千海宇的能量，共生之心进化为“鸿蒙海宇共生之心”，能吸收域外空间的能量转化为共生能量；灵汐突破至“灵海共生至尊境”，能操控所有灵海的能量，灵海水军的战力提升三倍；焚煞突破至“焚天共生至尊境”，焚天本源火进化为“跨域焚天火焰”，能灼烧域外至尊级的畸变能量；灵浩等年轻天才突破至鸿蒙海宇主宰巅峰境，成为联盟的中流砥柱。
神器方面，联盟炼制出“三千海宇共生至尊套装”，包括战甲、披风、战靴、头盔，套装融入了所有加盟海宇的道韵，能自动吸收共生能量，释放终极防御罩，还能与护道印产生共鸣，提升破邪斩的威力十倍；跨域破邪战舰的数量达到十万艘，每艘战舰都配备了“跨域共生核心炮”，能释放与石破天同源的破邪斩；“三千海宇共生阵”完成终极升级，能释放“鸿蒙海宇终极共生罩”，可抵御域外至尊级的全力攻击。
备战的第三千年，联盟终于完成了所有准备：石破天的实力达到“鸿蒙海宇共生至尊圆满境”，成为继上古传承者之后，第一位掌握完整共生道韵的至尊；二十座海宇的圣尊全部突破至域外主宰级；联盟军团的总兵力达到五十万亿人，配备十万艘跨域破邪战舰；三千海宇共生阵的能量储备达到巅峰，能连续释放十次终极破邪斩；学院培养出百万名天才修士，组成“少年共生军”，成为终极之战的后备力量。
就在此时，鸿蒙海宇的天空突然变暗，域外畸变之源的黑洞出现在天际，黑洞中涌出浓郁的紫黑能量，形成一道巨型虚影——那是域外畸变之源的本体，他的身体由无数畸变能量与负面情绪组成，气息达到“域外至尊圆满境”，比石破天还要强大。虚影看着下方的联盟军团，发出震耳欲聋的嘶吼：“渺小的生灵，三千年的准备结束了！今日，我将吞噬所有海宇，成为新的鸿蒙主宰！”
石破天飞身至主阵眼顶端，手持三千海宇共生至尊护道印，周身环绕着二十座海宇的道韵光纹，身后是五十万亿联盟修士组成的巨型战阵，战阵中无数道韵交织成网，释放出璀璨的金色光带。石破天的声音裹挟着共生道韵，响彻整个鸿蒙海宇：“联盟的勇士们，守护海宇的时刻到了！共生之道，源于魂体，固于信念！今日，我们要用共生的力量，彻底封印畸变之源，让三千海宇重归安宁！”
“封印畸变之源！守护海宇！”五十万亿修士同时呐喊，声音震彻域外，金色光带从战阵中爆发，直刺畸变之源的虚影。畸变之源冷笑一声，释放出无数巨型畸变触手，触手如山脉般砸向战阵，每一根触手都蕴含着能毁灭海宇的能量。石破天挥手催动三千海宇共生阵：“终极共生罩，启动！”金色光罩覆盖所有加盟海宇，将触手挡在外面。
“三千海宇共生至尊斩！”石破天注入全身道韵，护道印释放出一道贯穿域外的巨型刀芒，刀芒中蕴含着五十万亿修士的共生意志，直刺畸变之源的核心。畸变之源怒吼着释放终极畸变能量，与刀芒碰撞，金色与紫黑能量交织，形成一道覆盖千亿光年的能量漩涡，整个域外空间都在剧烈震颤，无数黑洞因能量波动而形成又消散。
“共生之道，永不止步！”石破天将共生之心的能量全部注入刀芒，刀芒的威力暴涨十倍，突破了畸变能量的防御，直刺畸变之源的核心。畸变之源发出痛苦的嘶吼：“不——！我不甘心！”核心被刀芒击中，紫黑能量如潮水般褪去，虚影逐渐消散，只留下一枚“畸变本源晶核”，晶核中蕴含着纯净的负面情绪能量。
石破天伸手握住晶核，用共生道韵净化其中的负面情绪，将其转化为纯净的共生能量，注入三千海宇共生阵。阵法的光幕暴涨至千万丈高，覆盖了整个域外空间，将所有残留的畸变能量彻底净化。天空重新变得晴朗，海宇本源长河的能量流速提升百倍，无数生灵在能量的滋养下突破境界，整个三千海宇都陷入了沸腾。
石破天站在主阵眼顶端，看着欢呼的生灵，眼中满是欣慰。灵汐、焚煞、灵浩等核心成员飞身至他身边，躬身行礼：“恭喜议长，彻底封印畸变之源！”石破天挥手扶起众人，看着远方的域外空间：“这不是结束，而是新的开始。三千海宇的共生之道，需要我们共同守护，未来，我们还要探索更广阔的域外空间，将共生之道传遍所有海宇！”
联盟在海宇本源共生城举行了盛大的庆典，二十座海宇的生灵汇聚于此，共同庆祝胜利。庆典上，石破天被推举为“三千海宇共生至尊盟主”，统领所有海宇文明；联盟制定了《三千海宇共生章程》，规定各文明平等互利、互助共生；学院更名为“三千海宇共生学院”，面向所有海宇招收学员，培养共生道韵的传承者。
庆典结束后，石破天站在海宇本源共生碑前，碑身刻着三千海宇的文明印记，以及所有为守护海宇牺牲的修士名字。他抚摸着碑上的名字，眼中满是敬意：“牺牲的勇士们，海宇安宁了，你们的精神将与共生之道永存！”碑身突然释放出金色光纹，形成一道虚影，虚影中是所有牺牲修士的笑脸，他们对着石破天点头，随后逐渐消散在空气中。